Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC8.02□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms