Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms