Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp19Q3UJD6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms