Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Puf60Q3UEB3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms