Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Rnf149Q3U2C5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rnf149Q3U2C5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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