Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc9Q3U0M1 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms