Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Srsf6Q3TWW8 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms