Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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