Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctdnep1Q3TP92 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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