Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Brip1os-202ENSMUST00000143819 2604 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc69Q3TCJ8 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms