Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccbe1Q3MI99 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms