Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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