Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trim71Q1PSW8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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