Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rundc1Q0VDN7 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms