Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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Ttc21bQ0HA38 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Ttc21bQ0HA38 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc21bQ0HA38 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Ttc21bQ0HA38 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc21bQ0HA38 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms