Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms