Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cntn3Q07409 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cntn3Q07409 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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