Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms