Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cacna1cQ01815 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms