Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mc1rQ01727 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms