Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbp4Q00724 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms