Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psme1P97371 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psme1P97371 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms