Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pkp1P97350 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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