Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Arf1P84078 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Arf1P84078 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Arf1P84078 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms