Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ptprn2P80560 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms