Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
UbdP63072 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UbdP63072 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UbdP63072 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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UbdP63072 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UbdP63072 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms