Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ufm1P61961 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ufm1P61961 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ufm1P61961 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ufm1P61961 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms