Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CgnP59242 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CgnP59242 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms