Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fgd1P52734 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgd1P52734 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms