Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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VegfbP49766 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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VegfbP49766 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Larp1b-204ENSMUST00000099121 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VegfbP49766 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms