Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms