Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf9P41274 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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