Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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RxrgP28705 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RxrgP28705 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RxrgP28705 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RxrgP28705 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RxrgP28705 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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RxrgP28705 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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RxrgP28705 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RxrgP28705 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RxrgP28705 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxrgP28705 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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