Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RxraP28700 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RxraP28700 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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