Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SagP20443 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SagP20443 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SagP20443 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SagP20443 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SagP20443 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SagP20443 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SagP20443 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SagP20443 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SagP20443 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SagP20443 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms