Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P20040 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P20040 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
P20040 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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