Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Defa-rs1P17533 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Defa-rs1P17533 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Defa-rs1P17533 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Defa-rs1P17533 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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