Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ptbp1P17225 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ptbp1P17225 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.6 ms