Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gabra6P16305 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms