Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm15104-201ENSMUST00000132626 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm44636-201ENSMUST00000206130 755 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms