Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl2P10148 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms