Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ccl20O89093 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl20O89093 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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