Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfdp1O88271 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cfdp1O88271 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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