Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vamp4O70480 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vamp4O70480 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vamp4O70480 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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