Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms