Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Clk2O35491 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms