Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Casq1O09165 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Casq1O09165 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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