Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa8J3QNX5 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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