Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms