Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Gm20914J3QME2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms